Laboratorio de Geomicrobiología

Se ensaya cómo servirse de las capacidades transformadoras de los microorganismos (Bacteria, Archaea y microalgas) en términos biogeoquímicos; es decir, nos interesa cómo la actividad de los microorganismos propicia cambios químicos en los minerales con los que interactúa. Trabajamos muy particularmente con microorganismos asociados a ambientes mineros, generalmente extremófilos, que pueden ser empleados para optimizar o generar nuevas técnicas de procesamiento mineral (biominería), para implementar estrategias destinadas a controlar y prevenir la contaminación por desechos mineros o bien aprovechar su potencial biotecnológico en otras áreas de interés, como biomateriales, biosensensores, y bioelectrogénesis. Se ha iniciado la conformación del primer Cepario a nivel nacional, de Microorganismos de importancia biominera, con cepas extremófilas.


Principales actividades

Las principales actividades que desarrollamos son el aislamiento, identificación y caracterización de microorganismos empleando medios de cultivo ad hoc y, a últimas fechas, técnicas de biología molecular y proteómica. Con apoyo de la infraestructura que ofrecen el Instituto de Metalurgia y otras dependencias de la UASLP (CIACyT, Instituto de Física y el laboratorio de Ciencias Básicas de la Facultad de Estomatología) y del IPICyT, analizamos el desarrollo y establecimientos de biopelículas microbianas sobre la superficie de minerales, así como la interacción de tales biopelículas con minerales, empleando para ello diversas técnica microscópicas (fluorescencia, barrido de láser, barrido de electrones, de fuerza atómica y electrónico de transmisión), espectroscópicas (Raman, pinzas ópticas, de luz-UV) que posibilitan tener un cuadro más completo de lo que sucede entre los microorganismos y los minerales así como de las transformaciones tanto de las partículas minerales como de las células microbianas. No obstante nuestro interés es interfacial, también evaluamos algunas características químicas y físicas del medio líquido donde sucede el proceso.

Las actividades descritas han sido y serán ofrecidas a diversos sectores sociales, tanto de educación como de la industria, incluyendo aislamiento de microorganismos, transferencia de muestras biológicas caracterizadas, identificación de microorganismos, resguardo de microorganismos en cepario, análisis del potencial biominero de poblaciones o comunidades microbianas, entre otras asocidas a las actividades descritas.

Servicios

Microorganismos con los que se trabaja: Bacterias, Archaeas, Microalgas.

Microorganismos con los que no se desea trabajar: hongos protistas, protozoarios, microorganismos de impacto en la salud humana.

Aislamiento, mantenimiento y manejo de cultivos de microorganismos extremófilos, principalmente provenientes de ambientes mineros.

Identificación de microorganismos por técnicas boquímicas y moleculares.

Conservación de cepas extremófilas de ambientes mineros.

Transferencia de cepas extremófilas de ambientes mineros (a futuro).

Estudios de interacción microorganismos-minerales, microorganismos-metales.

Estudios en minerales biogénicos y sus propiedades.

Estudios en Bioelectrogpenesis empleando microorganismos extremófilos.

Asesoría en técnicas para manejo de microroganismos extremófilos (cultivo, mantenimiento, conservación, observación).

En desarrollo: estudios en genómica y protéomica de enzimas que participan en metabolismo quimiolitotróficos y en tolerancia/resistencia a condiciones extremas.




Equipos

Microscopia:

Microscopios ópticos (2) con contraste de fase y campo oscuro (Leitz, modelo Galen III y Binolux BC-BNW).

Microscopio óptico de fluorescencia (Leica, DME), equipado con sistema de video y sistema de adquisición de imágenes digitales (Samsung modelo SSC-131-A).

CLSM-Raman ThermoScientific DX, con Láser de 532 nm (en laboratorio de procesamientos).

Pruebas Fisicoquímicas y electroquímicas:

Sistema de Análisis Electroquímico que consiste en potenciostato facilitado por Laboratorio de Procesamientos.

Cultivo y manejo de microorganismos:

Área estéril.

Incubadora (Lumistell modelo IHC-41) con control de temperatura.

Incubadoras (LabLine) con control de temperatura (2), una con control de atmósfera (O2, CO2).

Incubadora (Presision SC) con control de temperatura, una con control de atmósfera (O2, CO2).

Campanas de extracción de humos (Formalab).

Campanas de flujo laminar horizontal (Labconco).

Campana de flujo laminar vertical (Lumistel modelo LV-90).

Refrigeradores (4) para conservación de microorganismos y soluciones.

Congeladora para preservación temperatura mínima -20 °C (1).

Agitadores orbitales (4) (Lab Line Inc y Lumistell) con control de velocidad de agitación y control de temperatura (hasta 85 °C).

Campana climático ambiental para cultivo masivo de cultivos con ciclosde luz/oscuridad y humedad y temperatura ambiental programables.

De apoyo:

Centrífuga de mesa (Beckman); Rotor para microcentrifugación Beckman; Agitador vortrex.

Homogeneizador de mano.

pH/mV con electrodos de pH y ORP combinados (3).

Medidores de conductividad (2) (Cole Parmer).

Medidor de oxígeno disuelto (Orion 810).

Consolas de precisión (2) (L/S Masterflex) de velocidad variable con cartuchos multicanales con cuatro rodillos, flujo 17 a 1700 mL/min.

Balanzas analítica (2) (Ohaus) de capacidad de 220 g, precisión de 0.001 g.

Balanza de precisión de capacidad de 2 kg.

Baño María con control de temperatura (Precision Sc.).

Agitador ultrasónico (Cole Parmer).

Placas agitadoras (6) con control de agitación y control de temperatura.

Autoclaves eléctricas para esterilizar (2) autoclave de gas para esterilizar (1), entre otros.


Responsable

Dra. Jessica Viridiana García Meza

444 8261450 ext. 8258

jvgm@uaslp.mx